Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSSP25774 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms