Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA1P25391 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms