Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFX1P22670 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFX1P22670 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFX1P22670 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFX1P22670 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms