Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN1P18031 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN1P18031 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN1P18031 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN1P18031 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms