Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms