Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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