Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME1P15531 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME1P15531 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME1P15531 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms