Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRG2P13727 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms