Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms