Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A1P12074 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms