Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM225BP0DP42 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms