Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLK3P07288 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms