Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CYBBP04839 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYBBP04839 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms