Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms