Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms