Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NSD2O96028 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NSD2O96028 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSD2O96028 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms