Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms