Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NDUFS5O43920 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms