Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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