Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms