Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE40O14503 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms