Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms