Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PCH4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PCH4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PCH4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PCH4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E9PCH4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms