Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms