Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf58C9J3I9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf58C9J3I9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms