Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DXG7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DXG7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DXG7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DXG7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms