Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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