Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL13PA6NNM8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL13PA6NNM8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms