Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGPD3A6NKT7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms