Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms