Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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