Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms