Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC4Q9Y296 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms