Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms