Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms