Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms