Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMKLBQ9ULI2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms