Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKLN1Q9UL63 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms