Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms