Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms