Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms