Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5BQ9UGL1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms