Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT172Q9UG01 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms