Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms