Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms