Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPB1Q9UBR1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms