Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms