Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLAIN2Q9P270 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms