Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDP1Q9P0J1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms