Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms